総額制も処置料制も、治療費に大きな違いはありません。

総額制の方が毎回の会計する手間が省けるためスムーズです。
領収書も少なく医療費控除の申請などが楽です。

また、治療費の目安を立てやすいというメリットもあります。
費用を比較される場合は、処置料制は基本料+処置料x30回と計算すると良いです。
（ワイヤー矯正治療を月一回通院で２年半の治療期間として）